MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	ATT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
2	NC_017408	TC	3	6	292	297	0 %	50 %	0 %	50 %	387826487
3	NC_017408	A	6	6	308	313	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
4	NC_017408	TGC	2	6	347	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826487
5	NC_017408	ATT	2	6	413	418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
6	NC_017408	GAT	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
7	NC_017408	CCA	2	6	492	497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826487
8	NC_017408	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
9	NC_017408	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
10	NC_017408	A	7	7	621	627	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
11	NC_017408	TTG	2	6	656	661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826487
12	NC_017408	GAT	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
13	NC_017408	TAT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
14	NC_017408	TGA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
15	NC_017408	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826487
16	NC_017408	CAT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826487
17	NC_017408	T	7	7	970	976	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
18	NC_017408	CTT	2	6	982	987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826487
19	NC_017408	T	7	7	991	997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
20	NC_017408	AAT	2	6	1021	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826487
21	NC_017408	ATTT	2	8	1141	1148	25 %	75 %	0 %	0 %	387826487
22	NC_017408	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
23	NC_017408	AACA	2	8	1190	1197	75 %	0 %	0 %	25 %	387826487
24	NC_017408	AATA	2	8	1205	1212	75 %	25 %	0 %	0 %	387826487
25	NC_017408	T	7	7	1225	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
26	NC_017408	TTG	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826487
27	NC_017408	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
28	NC_017408	TCT	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826488
29	NC_017408	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826488
30	NC_017408	TTA	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826488
31	NC_017408	AAC	2	6	1379	1384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826488
32	NC_017408	AGCC	2	8	1408	1415	25 %	0 %	25 %	50 %	387826488
33	NC_017408	TTC	2	6	1456	1461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826488
34	NC_017408	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826488
35	NC_017408	AT	3	6	1602	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	387826488
36	NC_017408	A	8	8	1663	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	387826488
37	NC_017408	T	6	6	1745	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
38	NC_017408	ACAAA	2	10	1811	1820	80 %	0 %	0 %	20 %	387826488
39	NC_017408	AAG	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826488
40	NC_017408	AAT	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826489
41	NC_017408	T	8	8	2309	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
42	NC_017408	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826489
43	NC_017408	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
44	NC_017408	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
45	NC_017408	CTT	2	6	2382	2387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
46	NC_017408	TAT	2	6	2424	2429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
47	NC_017408	TCT	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
48	NC_017408	GTTT	2	8	2466	2473	0 %	75 %	25 %	0 %	387826489
49	NC_017408	T	7	7	2508	2514	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
50	NC_017408	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
51	NC_017408	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
52	NC_017408	TTA	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
53	NC_017408	TAT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
54	NC_017408	TTC	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
55	NC_017408	CTTTTT	5	30	2829	2858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826489
56	NC_017408	ATTT	2	8	2865	2872	25 %	75 %	0 %	0 %	387826489
57	NC_017408	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	387826490
58	NC_017408	T	6	6	2992	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
59	NC_017408	ATA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826490
60	NC_017408	CTC	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826490
61	NC_017408	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
62	NC_017408	AAGC	2	8	3111	3118	50 %	0 %	25 %	25 %	387826490
63	NC_017408	TAT	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
64	NC_017408	T	6	6	3145	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
65	NC_017408	TATT	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	387826490
66	NC_017408	TGC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826490
67	NC_017408	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
68	NC_017408	AGT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826490
69	NC_017408	AT	3	6	3461	3466	50 %	50 %	0 %	0 %	387826490
70	NC_017408	AC	3	6	3484	3489	50 %	0 %	0 %	50 %	387826490
71	NC_017408	TGT	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826490
72	NC_017408	TTA	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
73	NC_017408	TAG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826490
74	NC_017408	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
75	NC_017408	TTA	2	6	3692	3697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
76	NC_017408	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
77	NC_017408	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
78	NC_017408	TCC	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826491
79	NC_017408	T	6	6	3746	3751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
80	NC_017408	TA	3	6	3763	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	387826491
81	NC_017408	T	6	6	3781	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
82	NC_017408	ATT	2	6	3791	3796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826491
83	NC_017408	TTTCTT	2	12	3823	3834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826491
84	NC_017408	T	6	6	3833	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
85	NC_017408	CAA	2	6	3842	3847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826491
86	NC_017408	T	6	6	3884	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
87	NC_017408	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826491
88	NC_017408	CTTT	2	8	3942	3949	0 %	75 %	0 %	25 %	387826491
89	NC_017408	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
90	NC_017408	GTC	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826491
91	NC_017408	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
92	NC_017408	AAT	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826491
93	NC_017408	T	8	8	4043	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
94	NC_017408	T	8	8	4093	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
95	NC_017408	T	6	6	4148	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
96	NC_017408	TCT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826491
97	NC_017408	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
98	NC_017408	T	8	8	4223	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
99	NC_017408	ACT	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826491
100	NC_017408	T	8	8	4269	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
101	NC_017408	ATT	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
102	NC_017408	TAT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
103	NC_017408	GTT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826492
104	NC_017408	T	6	6	4340	4345	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
105	NC_017408	TAG	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826492
106	NC_017408	ATC	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826492
107	NC_017408	TTTAG	2	10	4451	4460	20 %	60 %	20 %	0 %	387826492
108	NC_017408	TAA	2	6	4531	4536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826492
109	NC_017408	T	6	6	4541	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
110	NC_017408	T	6	6	4561	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
111	NC_017408	AATTC	2	10	4583	4592	40 %	40 %	0 %	20 %	387826492
112	NC_017408	AAAG	2	8	4597	4604	75 %	0 %	25 %	0 %	387826492
113	NC_017408	TTA	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
114	NC_017408	TA	4	8	4626	4633	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
115	NC_017408	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
116	NC_017408	TAT	2	6	4647	4652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
117	NC_017408	TCTT	2	8	4700	4707	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
118	NC_017408	TCTT	2	8	4721	4728	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
119	NC_017408	TTAA	2	8	4736	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
120	NC_017408	CTA	2	6	4757	4762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826492
121	NC_017408	ATCA	2	8	4771	4778	50 %	25 %	0 %	25 %	387826492
122	NC_017408	TA	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
123	NC_017408	T	6	6	4860	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
124	NC_017408	TTAA	2	8	4880	4887	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
125	NC_017408	T	6	6	4927	4932	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
126	NC_017408	TA	4	8	4941	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
127	NC_017408	TGA	3	9	4979	4987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826492
128	NC_017408	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
129	NC_017408	T	8	8	5047	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
130	NC_017408	TTTA	2	8	5062	5069	25 %	75 %	0 %	0 %	387826492
131	NC_017408	T	7	7	5091	5097	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
132	NC_017408	ATTT	2	8	5121	5128	25 %	75 %	0 %	0 %	387826492
133	NC_017408	T	7	7	5169	5175	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
134	NC_017408	CTAA	2	8	5464	5471	50 %	25 %	0 %	25 %	387826493
135	NC_017408	ATT	2	6	5514	5519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826493
136	NC_017408	T	6	6	5540	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	387826493
137	NC_017408	TCT	2	6	5560	5565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826493
138	NC_017408	AAT	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826493
139	NC_017408	AT	3	6	5674	5679	50 %	50 %	0 %	0 %	387826493
140	NC_017408	CAC	3	9	5705	5713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826493
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